Nghiên cứu Y học
DETECTION OF PATHOGENIC E.COLI IN FOOD (EPEC, ETEC, EHEC)
WITH MULTIPLEX-PCR ASSAY
Bấm tải bài viết
Tạp chí Y học Thành phố Hồ Chí Minh, 18(6):469. DOI
Lượt xem: 194 Lượt tải PDF: 0
Tác giả
Nguyễn Thị Anh Đào*, Nguyễn Đỗ Phúc*
Tóm tắt
Đặt vấn đề: Trong những năm gần đây, E. coli trở thành một tác nhân gây bệnh tiêu chảy nguy hiểm lây truyền qua con đường thực phẩm và có liên quan tới nhiều vụ ngộ độc của các nước trên thế giới, ngay ở cả các nước phát triển như Anh, Nhật, Mỹ, Đức…..Vì thế, việc xác định được chính xác các nhóm E. coli gây bệnh nhiễm trong thực phẩm là thật cần thiết.
Mục tiêu nghiên cứu: Xác định một số nhóm E. coli gây bệnh (EPEC, ETEC, EHEC) trong mẫu thực phẩm bằng kỹ thuật multiplex PCR.
Phương pháp: Khảo sát độ chọn lọc và độ đặc hiệu của phương pháp multiplex-PCR. Đánh giá các thông số kỹ thuật của phương pháp multiplex-PCR: giới hạn phát hiện, độ nhạy tương đối, độ chính xác tương đối, độ đặc hiệu tương đối, tỷ lệ dương tính giả và âm tính giả theo ISO/TS 16140 (2003).
Kết quả: Giới hạn phát hiện của phương pháp multiplex-PCR trên các nền mẫu (sữa 1-3 CFU/25g, thủy sản 2-6 CFU/25g và thịt 2-7 CFU/25g). Các thông số kỹ thuật của phương pháp multiplex-PCR: độ chính xác tương đối (AC) (sữa: 100%, thủy sản: 95% và thịt: 91,67%); độ đặc hiệu tương đối (SP) (sữa: 100%, thủy sản: 96,67% và thịt: 90%) và độ nhạy tương đối (SE) (sữa: 100%, thủy sản: 93,33% và thịt: 93,33%)
Kết luận: Ứng dụng phương pháp multiplex-PCR đối với một số nhóm E.coli gây bệnh (EPEC, ETEC, EHEC) trong mẫu thực phẩm và trong các vụ dịch ngộ độc.
Từ khóa: Multiplex-PCR, EPEC, ETEC, EHEC, thực phẩm,…
Abstract
DETECTION OF PATHOGENIC E.COLI IN FOOD (EPEC, ETEC, EHEC)
WITH MULTIPLEX-PCR ASSAY
Nguyen Thi Anh Dao, Nguyen Do Phuc
* Y Hoc TP. Ho Chi Minh * Vol. 18 - Supplement of No 6- 2014: 469 – 473
Background:
In recent years, E. coli has become a dangerous diarrheal pathogen
transmitted through food and caused a number of food-born outbreaks
worldwide, even in the developed countries, such as the UK, Japan,
America, German, ect. Therefore, exactly detecting pathogenic E.coli in
contaminated food is needed.
Objective: Detecting pathogenic E. coli (EPEC, ETEC, EHEC) in food by multiplex-PCR assay.
Methods:
Examining selectivity, specificity of multiplex-PCR and evaluating
technical parameters of multiplex-PCR, including detection limit,
relative sensitivity, accuracy, specificity, false positive and
negative.
Result: Limit
of detection: dairy (1-3 CFU/ 25ml or g), aquatic products (2-6 CFU/
25g), and meat (4-7 CFU/ 25g). Technical parameters of multiplex-PCR:
accuracy (AC) (dairy: 100%, aquatic products: 95% and meat: 91.67%);
specificity (SP) (dairy: 100%, aquatic products: 96.67% and meat: 90%);
sensitivity (SE) (dairy: 100%, aquatic products: 93.33% and meat:
93.33%).
Conclusion: Application of multiplex-PCR for detection of pathogenic E. coli (EPEC, ETEC, EHEC) in food and the food born outbreak.
Keywords: multiplex-PCR, EPEC, ETEC, EHEC, food,…
